RNA结合蛋白（RNA binding proteins, RBPs）自RNA转录起始，就常与之相伴。在RNA寿命的不同阶段，会和不同类型的RBP结合形成核糖核蛋白（RNP）复合体，介导其成熟、转运、定位和翻译过程的调控。真核生物编码的RBP极为多样，通过各自特异的RNA识别和结合机制，调控RNA代谢的方方面面。

基因和蛋白的表达实验广泛用于基因组学、蛋白质组学、系统生物学的研究。shRNA（short hairpin RNA，shRNA）是一段短发卡RNA序列，是设计为能够形成发卡结构的非编码小RNA分子，因其具有特殊的茎环结构，在哺乳动物细胞中可以长期甚至稳定地发挥RNA干扰，该技术已经成为研究哺乳动物体内外基因功能强大有力的工具。