文章简介
文章题目 | Single-cell and spatial transcriptome analyses revealed cellular differences in liver metastatic colorectal cancer |
中文题目 | 单细胞和空间转录组分析揭示了肝转移性结直肠癌的细胞异 |
期刊名 | Science Advances |
IF | 11.7 |
发表时间 | 2023.06 |
科学问题 | 癌细胞和基质细胞之间的交流在促进转移扩散中起着至关重要的作用,但很少有研究报道原发性和转移性结直肠癌之间的相互作用网络差异。 |
实验设计 | 五组分为原发性结直肠癌(CC)、邻近正常结直肠粘膜(CN)、肝转移(LM)、邻近正常肝组织(LN)和外周血(PB),共27个样本进行scRNA-seq,同时对4例原发性(C1-4)和2例肝转移性肿瘤(L1-2)进行空间转录组(ST)测序(10x Visium)。 |
空间转录组分析结果展示
以scRNA-seq数据为参考, Stereo-seq保留了62,155个合格细胞并注释出9种主要的细胞类型,包括T/NK细胞、B细胞、浆细胞、巨噬细胞、树突状细胞、胆管细胞或恶性细胞、肝细胞、内皮细胞和成纤维细胞。
肝癌中四个区域(T、M、P和LN)的细胞组成和空间分布具有高度异质性,除主要的肿瘤细胞和肝细胞外,T/NK细胞、B细胞和成纤维细胞是最丰富的细胞。另外,肿瘤组织中的内皮细胞和浆细胞要多于其他区域,而成纤维细胞和巨噬细胞倾向于富集在边缘区域的肿瘤相邻位置,B细胞在淋巴结中最为丰富,与癌旁组织相比,肿瘤边缘区域的癌旁部分富集了更多的成纤维细胞。在空间上,巨噬细胞等免疫细胞主要富集在肿瘤边界的边缘区域,表明肿瘤边界周围存在独特的免疫微环境。对不同肿瘤区域的微环境进行分析表明肿瘤边缘区域可能是一个复杂的区域,其特征是缺氧微环境、强烈的炎症反应和高免疫逃逸。
文章主要结论和意义
本研究联合10X Visium和scRNA-seq绘制了肝癌不同组织的单细胞和空间转录组图谱,解析了肿瘤细胞侵袭正常肝细胞边界区域的细胞组成、分子特征及相互作用,确定并描述了一个以肿瘤侵袭边界为中心的“侵袭前沿区”。 在该区域内包含一个复杂而动态的局部肿瘤生态系统,可以决定肿瘤侵袭的风险和患者的预后,这对于探索肿瘤转移的机制和开发更精确和有效的肝癌新疗法至关重要。