最近总有科研同行和临床医生在问,为什么做生信的如此高产,5分文章轻轻松松,10分文章努力一下子也不是没有可能?就小编团队这些年的生信分析经验,用对了生物信息学分析方法,效率可以很高,一个月成文也不是没可能啊。下面我们一起来看看这篇一个月成文的论文吧。
研究背景
白癜风是由表皮黑色素细胞破坏引起的常见脱色病症。目前认为其主要与遗传、免疫、氧化应激、神经调节和其他因素有关。白癜风发病机制的研究主要集中在黑素细胞的内在损伤和T细胞介导的特异性免疫反应。如自然杀伤(NK)细胞、CD8+T细胞等,然而白癜风发病机制尚不清楚。免疫细胞浸润和特定基因的异常表达与发病机制密切相关。基因表达的差异可能与免疫细胞的类型有关。
研究方法和主要发现
前期研究显示在白癜风的发生发展中,免疫细胞浸润和特定基因的异常表达与发病机制密切相关。基因表达的差异可能与免疫细胞的类型有关。我公司选择对本研究结合综合生物信息学方法和表达分析技术,基于先前报道的白癜风患者皮肤样本(GSE53146和GSE75819)和外周血样本(GSE80009和GSE90880)的基因表达数据,对比健康人的样本,探索白癜风的发病机制。我们首先在每个数据集中进行 DEG分析,然后对DEG基因进行功能注释和通路分析。我们还分析了不同数据集的免疫细胞类群。随后对这些免疫细胞群和 DEG 进行共表达分析,以研究白癜风皮肤和外周血中免疫细胞的基因表达特征。这些发现加深了对白癜风免疫和炎症反应具体机制的了解,并为白癜风的治疗提供新的潜在靶点。
展示作者所研究部分图例:
总结:
这项研究下载了GEO数据库已经发表的白癜风患者的皮肤组织样本的转录组数据和白癜风患者的外周血的转录组数据,对差异的DEG基因和免疫细胞的类型进行相关性分析。筛选出与免疫细胞相关的基因。本研究证实,在白癜风的发展过程中,巨噬细胞、B细胞和NK细胞的水平随着T细胞的激活而升高;同时说明了外周血免疫细胞在白癜风的发病机制中起重要作用,免疫和炎症相关重要基因与白癜风免疫细胞浸润相关。本研究为白癜风的临床诊治提供了新的理论依据。
参考文献
Zhang, J., Yu, S., Hu, W., Wang, M., Abudoureyimu, D., Luo, D., … & Kang, X. (2021). Comprehensive analysis of cell population dynamics and related core genes during vitiligo development. Frontiers in genetics, 12, 167.
[武汉瑞兴生物]提供数据下载分析服务,可用于课题申请的前期准备和作为文章发表的前期结果。了解服务详情可通过下方联系方式联系我们。
联系电话:027-87050299
联系邮箱:sales@rxbio.cc