转录组测序分析可变剪接轻松上6分-快来抄作业
这项研究利用转录组测序技术揭示了不同时期慢性髓系白血病患者的转录图谱。运用ABLas可变剪接分析流程比较了两类患者中的可变剪接调控模式,急变期白血病患者表现出更显著的剪接失调。筛选出辅助剪接因子hnRNPA1可作为区分白血病患者和健康人的的生物标志物。实验证明hnRNPA1的全长剪接亚型A1-b在急变期患者中表达明显升高,这种独特的表达模式可能为白血病急慢性患者的分类提供新的预后指标。
We translate sequences to science and industry.
这项研究利用转录组测序技术揭示了不同时期慢性髓系白血病患者的转录图谱。运用ABLas可变剪接分析流程比较了两类患者中的可变剪接调控模式,急变期白血病患者表现出更显著的剪接失调。筛选出辅助剪接因子hnRNPA1可作为区分白血病患者和健康人的的生物标志物。实验证明hnRNPA1的全长剪接亚型A1-b在急变期患者中表达明显升高,这种独特的表达模式可能为白血病急慢性患者的分类提供新的预后指标。
首先,通过构建IGF2BP2敲除的巨噬细胞,探索炎症诱导下,IGF2BP2敲除对M1和M2型巨噬细胞激活的影响;
其次,通过iRIP-seq等实验明确了IGF2BP2在巨噬细胞表型激活中的作用机制;
最后,通过建立结肠炎和哮喘小鼠模型,利用小鼠的骨髓细胞交叉移植等实验,验证了IGF2BP2在炎症疾病中的功能。