RNA结合蛋白是什么？

RNA结合蛋白（RNA binding proteins, RBPs）是指在细胞中能够与双链或单链RNA结合并形成核糖核蛋白复合物的一大类蛋白。 RNA结合蛋白可以与circRNA，lncRNA，miRNA非编码RNA结合互作，同时和当下肿瘤免疫，T细胞免疫治疗法，m6A修饰，单细胞测序，可变剪切，CRISPR-Cas9，等很多热点都有密切关系，并有重大发现，很值得我们深入研究。 没有RBPs，RNA无法发挥任何生理作用。

特色服务——RBP的iRIP数据包

iRIP-seq(Improved RIP-seq)是我们自主开发用于研究RBPs的新技术，该技术既实现了CLIP-seq的精准度，又保留了RIP-seq 简单性。 iRIP-seq技术可以鉴定与特定RBP相互作用的RNA，获得结合基序、结合强度和结合靶标等信息，可以为沉默/过表达产品的分析结果提供更稳固和更直接的证据，从整体水平研究RBP的功能和作用机制。

与RBP相关的疾病列表

  • 耳鼻喉科
  • 眼科
  • 呼吸科
  • 肾病科
  • 内分泌科
  • 神经内科
  • 神经外科
  • 精神科
  • 肿瘤
  • 血液病科
  • 风湿免疫科
  • 其他
  • 听觉损伤，耳聋，耳疾，过敏性鼻炎，鼻疾，咽喉疾病，颈部疾病等
  • 白内障，青光眼，视网膜色素变性等
  • 慢性阻塞性肺疾病，哮喘，肺纤维化等
  • 肾损伤，肾衰竭等
  • 糖尿病，甲状腺机能亢进，骨质疏松症等
  • 阿兹海默症，肌肉萎缩性侧索硬化症，脊髓性肌萎缩症，帕金森病，多动症等
  • 脑血肿，动脉瘤，烟雾病，癫痫，胶质瘤，垂体瘤等
  • 精神分裂症，自闭症，抑郁症等
  • 胰腺癌，结肠癌，膀胱癌，肺癌，乳腺癌，食管癌，肝癌，胃癌，甲状腺癌，卵巢癌等
  • 骨髓增生异常综合征，白血病，淋巴瘤，再生障碍性贫血等
  • 系统性红斑性狼疮，高尿酸血症，骨关节炎，类风湿性关节炎等
  • 心血管，消化系统，骨科，泌尿系统，产科，儿科疾病等

超值配套服务

  • 高通量数据解读指导
  • 对结题报告进行视频培训和个性化解读指导，提升将数据转化为科学发现的能力。
  • 个性化文章支持
  • 可根据您的需要，利用瑞兴生物的组学基础知识，强大的科学研究团队，还有专业的生物大数据分析团队，解读数据；有助于精准找到研究创新点，将RBP数据中的科学价值发挥到极致！
  • 延申设计
  • 我们拥有研究RBP的专业团队，可根据您的科研需要，结合不同的实验技术设计研究方案；而且RBP功能多样，作用机制复杂，毫不夸张的说，选定一个RBP，您的团队可以一直研究下去。

案例解析

案例解析1

文章概述：
在本研究中，作者旨在阐明与IGF2BP2发生相互作用的转录本、全转录组以及GCs中的可变剪接，从而揭示PCOS发病的潜在机制。

材料与方法：采用定量反转录PCR (RT-qPCR)和Western Blot检测PCOS患者GCs中IGF2BP2的表达。通过RNA免疫沉淀测序(RIP-seq)和RNA测序(RNA-seq)捕获了IGF2BP2相互作用的转录本、全转录组以及可变剪接。转染过表达IGF2BP2质粒和核因子1 c型(NFIC) siRNA的KGN细胞，并利用CCK-8、EdU和TUNEL进行检测。

结果展示

作者在KGN细胞中通过RIP-seq分析了与IGF2BP2相互作用的转录本，免疫沉淀表明IGF2BP2主要与mRNA的3’和5’UTR结合。

图一：利用RNA免疫沉淀测序分析IGF2BP2的结合谱和结合基序

IGF2BP2调控NFIC的AS，进一步促进GCs增殖

图二： IGF2BP2过表达调控NFIC的可变剪接

结论：

在本研究中，作者在KGN细胞中通过RIP-seq和RNA-seq分析了RNA结合蛋白IGF2BP2相互作用的转录本和全转录组及AS。值得注意的是，其研究证明了IGF2BP2通过调节PCOS中NFIC的AS促进GC增殖。研究结果为PCOS的发病机制研究提供了新的见解，并为PCOS新的诊断标志物和治疗靶点提供了机会。

案例解析2

文章概述：

编码NR3C1的糖皮质激素受体具有RNA结合蛋白和转录因子的双重作用，最近的研究表明NR3C1可能在创伤后应激障碍(PTSD)的发病机制中发挥重要作用应激障碍。在本研究中，将NR3C1过表达质粒转染HT22细胞，构建神经元细胞模型，通过RNA测序分析NR3C1过表达后HT22细胞整体转录水平的变化和选择性剪接事件。结果表明，NR3C1可以调控炎性转录因子的表达及选择性剪接模式，进而影响下游靶标的表达，可能导致PTSD的发生。本研究将为研究nr3c1介导的基因调控与PTSD的关系提供新的思路。

结果展示

RNA-seq结果展示

可变剪接和reads分布图