Systems genetics identifies a convergent gene network for cognition and neurodevelopmental disease

1.通过共表达调控网络的构建,建立了脑组织基因表达的module;
2. 采用多套脑组织相关的数据,其数据类型包括芯片、转录组、GWAS、外显子组,通过多套数据的组合分析,鉴定了2类基因modules(共1298个基因)与脑部认知疾病关联;
3. 同时对这1298个基因在不同脑部组织及脑部不同发育时期的基因表达模式也进行了分析;
4. 为GWAS和外显子数据的整合分析提供了很好的思路;

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Discovery, Annotation, and Functional Analysis of Long Noncoding RNAs Controlling Cell-Cycle Gene Expression and Proliferation in Breast Cancer Cells

1. LncRNA 长度大于200nt的非编码RNA,具有高度细胞特异性,新LncRNA有待发现及研究
2.二代测序技术给LncRNAs的鉴定与注释带来了极大的便利
3.研究表明LncRNA与疾病具有密切关系(细胞核及胞浆LncRNA具有不同的功能)
4.多种癌症的发生于特定的LncRNA密切相关(prostate cancers: the lncRNAs SChLAP1,PCAT-1, PCGEM1, and PRNCR1; breast cancers : BCAR4)
5.乳腺癌发生过程中LncRNA的分子机制暂不清楚

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Systematic identification of factors for provirus silencing in embryonic stem cells

1. 原病毒(provirus),是存在于宿主染色体内的,潜在的病毒染色体组,可以从一代宿主细胞转移到另一代细胞中而不使宿主破裂。
2.前人的研究显示provirus在胚胎干细胞中的表达是受到抑制的,但具体的机制尚不清楚。
3.siRNA screen ,RNA-seq、chip-seq等成熟技术为系统性鉴定细胞调控因子提供了方便。

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