Metatranscriptome analyses indicate resource partitioning between diatoms in the field.

不同类群的海洋浮游植物进行着全球一半的初级生产。浮游植物巨大的多样性长期以来困扰着生态学家,因为这些微生物共存于一个同质的环境,同时争夺相同的基本资源(如无机养分)。资源的差异化生态位分离是一种假说来解释这种”悖论的浮游生物”,但很难原位量化和跟踪浮游植物的代谢变化。

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NAD captureSeq indicates NAD as a bacterial cap for a subset of regulatory RNAs 原核生物RNA的NAD帽子结构

海德堡大学的Andres Jaschke研究团队于今年在Nature上报道了第一个原核生物中的 RNA 5’端帽子结构。真核生物mRNA中的5’端帽子结构不存在于原核生物中,长期以来人们认为原核mRNA中不存在5’端帽子结构。Andres Jaschke研究团队利用化学-酶捕获和NGS手段(NAD CaptureSeq)发现了细菌RNA中的5’-NAD帽子结构,并证实这种帽子结构同样具有保护RNA分子的功能。

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IVT-seq reveals extreme bias in RNA sequencing

宾夕法尼亚大学的研究者们最近使用了一项新技术来检测在RNA-seq建库和测序过程中人为引入的偏好。高通量RNA测序技术已称为基因表达和转录组分析的重要手段,但人们对不同的建库方法引入的偏好(bias)了解不足,迄今为止也没有好的手段来估算这种偏好。John B. Hogenesch的研究团队展示了通过体外转录组测序(in vitro transcription seq,IVT-seq)估算偏差的方法,可能为今后的实验设计和方法改进提供参考。

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Early life dynamics of the human gut virome and bacterial microbiome in infants

近期的Nature Medicine杂志来自美国华盛顿大学(St. Louis)医学院的一项最新研究发现,细菌可不是婴儿出生后“入侵”肠道的唯一生物种类,病毒也会“趁虚而入”,它们都对人体健康有着重要的影响。该研究分析了8名健康婴儿从出生到两岁的粪便样品,从而跟踪其肠道微生物组和病毒组的变化规律,,堪称肠道病毒组研究开山之作之一。

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