miRNA-seq揭示小RNA或成为弥漫性大B细胞淋巴瘤的新的诊断标志物
2015年麻省理工Technology Review把液体活检列为十大技术突破之一,同年,欧盟批准将循环肿瘤DNA检测用于易瑞沙的伴随诊断,标志着高通量测序技术在临床应用的大突破。近年来随着TCGA(The Cancer Genome Atlas)的癌症遗传数据库不断完善,未来有望开发新的临床诊断标志物。
详情We translate sequences to science and industry.
2015年麻省理工Technology Review把液体活检列为十大技术突破之一,同年,欧盟批准将循环肿瘤DNA检测用于易瑞沙的伴随诊断,标志着高通量测序技术在临床应用的大突破。近年来随着TCGA(The Cancer Genome Atlas)的癌症遗传数据库不断完善,未来有望开发新的临床诊断标志物。
详情周所周知,piRNA机械有介导转座子的表观遗传沉默的作用。最近的研究表明,这一功能还涉及转座子来源的转录本的piRNA导向切割。由于许多piRNA似乎也有针对不同mRNA的能力,这提出了一个有趣的可能性即piRNA可以广泛的作为siRNA并降解特定的mRNA。
详情ABLife直接参与了本研究
可变聚腺苷酸化(APA)是一种普遍的基因调控机制并与开花相牵连,但植物从营养生长到生殖生长转换期间调整选择特定poly(A)位点的分子基础仍不清楚。
来自德国马克斯-德尔布吕克分子医学研究中心的Schuman和陈炜的研究团队,对小鼠的不同组织进行RNA深度测序,发现circRNA在小鼠大脑中高度表达而且有很大一部分来自编码突触蛋白的基因。研究显示,许多circRNA的丰度在突触形成时突然改变,说明circRNA可能在发育过程中调控突触的功能。
详情来自德国马克斯-德尔布吕克分子医学研究中心的Rajewsky及其同事,为我们提供了一个人脑circRNA的详细图谱,环状RNAs在哺乳动物脑中格外富集、序列保守且动态表达。
环状RNAs(circular RNAs,circRNAs)是一类内源性动物RNAs。研究人员对来自不同脑区、原代神经元、孤立突触以及神经元分化期间的RNA进行了序列测定和计算机分析。在人和小鼠中分别检测到65,731和15,849个候选circRNA。circRNAs在神经元分化中是总体表达升高的,在突触中高度富集,并且与它们的mRNA isoforms相比,通常是差异表达的。circRNA表达与RNA编辑酶ADAR1的表达负相关。ADAR1沉默可诱导circRNA表达升高。
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