1.文章简介
| 文章题目 | Discovery, Annotation, and Functional Analysis of Long Noncoding RNAs Controlling Cell-Cycle Gene Expression and Proliferation in Breast Cancer Cells |
| 中文题目 | |
| 期刊名 | |
| 作者 | |
| 发表时间 | 2015 |
| 实验材料 | |
| 测序平台 | |
| 相关产品 | RNA-seq |
长链非编码RNAs (lncRNA)是一类长度大于200 bp，不编码蛋白质的RNA分子。大量的研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用。然而，到目前为止，各类细胞中的lncRNA种类、数量、功能都不明确。
GRO-seq (Global Run-On Sequencing)是一项可以在整个基因组范围上绘制参与转录的RNA聚合酶的位置、数量和定位的测序技术。德克萨斯大学的科研工作者通过联合分析GRO-seq和RNA-seq 数据的方法，发现该方法能有效提高低丰度LncRNA的检出率，他们在人的乳腺癌细胞MCF-7中发现了700多种新的LncRNA。对两种新的LncRNA (lncRNA152 & lncRNA157) 进行功能分析发现， 它们在细胞增殖、E2F依赖的细胞周期基因表达，和雌激素依赖的促有丝分裂生长中都有重要的调控作用。
原文出处：
Sun M, Gadad SS, Kim DS, Kraus WL, 2015.Discovery, Annotation, and Functional Analysis of Long Noncoding RNAs Controlling Cell-Cycle Gene Expression and Proliferation in Breast Cancer Cells. Mol Cell, 59(4):698-711.
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