技术介绍
细胞通过一组交互式调节机制（例如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和转录因子活性）来控制其基因表达。染色质可及性在很大程度上反映了细胞的综合调控状态。因此，细胞的染色质可及性谱与其转录组一起充当信息层来描述细胞身份。此外，探索染色质可及性谱可以进一步了解 scRNA-seq 数据可能无法捕获的基因调控机制和细胞分化过程。
scATAC-seq（single-cell Assay for Transposase-Accessible Chromatin with sequencing）是一种单细胞水平的染色质开放性检测技术。它的核心思想是利用 Tn5 转座酶 将测序接头插入到基因组中开放的染色质区域，然后通过高通量测序读取这些片段，从而获得每个单细胞中染色质可及性的分布情况。
相比传统的 bulk ATAC-seq，scATAC-seq 可以揭示不同细胞群体在调控元件（如增强子、启动子、转录因子结合位点等）可及性上的异质性。
技术优势
✔ 数据质量高（核心优势）：先对混合细胞核进行批量转座，后再进行单细胞分离与标记，避免了在液滴生成过程中因细胞核破损造成的分子交叉污染，显著降低了背景噪音，从而获得信噪比更优、数据质量更高的测序结果。
✔ 细胞通量大：基于微流控液滴技术，单次运行可高效捕获数千至上万个细胞核，能够满足对复杂细胞群体进行大规模取样的研究需求。
✔ 性价比优异：作为国产平台，成本相较于国外同类技术方案更具竞争力，为广大研究者提供了更低门槛的单细胞表观遗传学研究工具。
技术应用
1.解析细胞异质性
在复杂组织或肿瘤中区分不同的细胞类型和亚型。即使是稀有或过渡状态的细胞，也可以通过染色质可及性谱被识别出来。
2.检测疾病或治疗过程中的动态变化
监测不同发育阶段、疾病进程或药物处理过程中染色质开放状态的变化。例如，追踪抗癌药物对染色质可及性及基因调控的影响。
3.揭示调控元件
识别不同细胞类型特异的启动子、增强子和转录因子结合位点。帮助发现调控基因表达的关键因子及潜在治疗靶点。
4.将表观遗传学与基因表达联系起来
通过与scRNA-seq联合分析，把染色质可及性和基因表达模式对应起来。揭示转录因子在不同发育过程或疾病中的调控机制。
技术流程
从生物样本（如组织等）中分离出细胞核，接着对细胞核进行转座酶处理，使染色质开放区域 DNA 片段化，然后利用DNBelab C系列平台进行单细胞分选，将处理后的 DNA 构建文库，再通过测序获取数据，后续经数据分析（如峰识别、聚类、 motif 富集等），以解析单细胞染色质可及性信息 。
实测数据
