技术简介

靶向空间组学技术，具有高灵敏度、高特异性以及高分辨率等特性，可实现单碱基和亚细胞分辨率的基因定性与定量检测。

技术服务目前包含低通量基因的组织细胞精准定位、单细胞空间图谱绘制、三维空间图谱构筑、RNA/蛋白共检、宿主微生物双重空间组分析等等。

该技术将空间组学与单细胞测序联合应用，可实现高分辨的单细胞空间图谱构建，是单细胞测序、空间组下游验证必备工具。广泛适用于临床和科研领域，助力生命科学研究与临床精准诊断。

技术优势

✔ 单细胞、单分子、单碱基分辨率

✔ 特异性强、灵敏度高、应用范围广泛

✔ mRNA,micRNA、IncRNA、snRNA

✔ 剪切变体、SNP检测全覆盖

✔ 基因组合自由、靶标全定制化

✔ 各类物种、器官全覆盖

✔ 冰冻、石蜡、细胞、新鲜、“上古”样本

✔ RNA/蛋白一网打尽 

技术应用

01 低通量的基因原位检测​

单细胞、空间组的必备验证

02 单细胞空间图谱绘制

联合单细胞测序，以低成本方式产生高分辨的组织空间图谱

03 三维空间图谱

告别马赛克二维平面空间组,构建全组织的三维基因表达图谱,探索基因在三维空间的表达模式

01 连续或间断切片,多张2D图像空间对准,最终实现三维重构

02 整组织透明检测,荧光显微镜深度成像逐层扫描,实现整组织三维空间图谱解析

04 RNA-蛋白多维空间组

在同一张切片上,同时检测基因和蛋白的空间位置信息和相互作用关系

05 宿主一微生物双重空间组

在同一张切片上,微生物和宿主基因的空间表达信息和相互作用关系

文献案例

英文题目：Nuclear ANLN regulates transcription initiation related Pol II clustering and target gene expression

中文题目：细胞核ANLN蛋白调控转录起始相关的RNA聚合酶II聚集和靶基因表达

发表时间：2025.2

期刊：《Nature Communications》（双一区，IF=14.7）

DOI：10.1038/s41467-025-56645-9

研究背景

食管鳞癌（ESCC）中的 Anillin（ANLN）是一种有丝分裂蛋白，异常高表达可促进 ESCC 发生，但对其深层分子调控机制了解不足，本研究致力于探究这一问题。

研究内容

1.ANLN 与转录调控关系的发现：在不同癌细胞中发现核内 ANLN 与染色质及新生 RNA 共定位，推测其参与基因转录调控。通过多种实验证实 ANLN 与 RNA 聚合酶 II（Pol II）大亚基直接互作，且二者在基因组上共定位并形成核内转录凝聚体。ANLN 调控 Pol II 的聚集和液 – 液相分离，通过其无序区特定序列与 Pol II 互作促进 Pol II CTD 相分离。

2.ANLN 对基因表达的影响：敲降 ANLN 会降低 Pol II 活性，减弱增强子和超级增强子信号，调控特定基因表达。结合 RNA – Seq 和 CUT&Tag 技术，筛选鉴定出 ANLN – Pol II 轴的直接靶基因，这些基因多受超级增强子调控，ANLN 与 Pol II 及多种转录因子结合于超增强子区域。

3.MiP – seq 技术的验证：利用单细胞分辨率空间多组学技术（MiP – seq）对特定靶基因和蛋白的空间位置进行验证，观察到在典型原癌基因 CCND1 和 TXNRD1 的启动子及增强子区域，ANLN 蛋白与其协同空间定位。ANLN 蛋白主要与靶基因共表达，而非管家基因，表明 ANLN 介导的基因转录具有基因特异性。