技术介绍
平行反应检测(Parallel Reaction Monitoring,PRM)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子检测技术, 能够对目标蛋白质、目标肽段进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质及肽段的相对或绝对定量。PRM 可与传统蛋白质验证(Western Blot/ELISA)技术互补,使蛋白验证更加简单,选择性更多。典型适用于高通量蛋白质组定量数据的验证、临床样品中biomarker蛋白分子的定量检测。
产品优势
1.依据unique peptide 进行定量,结果更可靠
2.一次可检测几十个蛋白
3.周期明确、风险可控
2.一次可检测几十个蛋白
3.周期明确、风险可控
结果展示
案例解析
通过数据依赖性采集 (DIA) 质谱分析和平行反应监测 (PRM) 验证,鉴定血清生物标志物以预测培美曲塞/铂类化疗对晚期肺腺癌患者的疗效(translational lung cancer research,IF=6.496)
培美曲塞/铂类化疗是肺腺癌患者的标准化疗方案,但疗效差异很大。为了发现新的血清生物标志物来预测培美曲塞/铂类化疗的疗效,作者对20例接受培美曲塞/铂类化疗的晚期肺腺癌患者的血清样本进行了DIA蛋白质组学检测。化疗响应良好组(PR)与化疗响应差(PD)组相比共得到23个差异蛋白,其中7个蛋白对于治疗响应预测的ROC AUC值高于0.8。为了进一步验证DIA蛋白质组学结果,作者使用RPM在这20名患者的研究队列和一个新的、包含22名晚期肺腺癌患者(16名PR和6名PD)的队列中检测了16个候选血清生物标志物。PRM验证与DIA蛋白质组学表现出较好的一致性,10种差异蛋白质显示出类似的上调或下调。总体,研究者通过DIA蛋白质组学和PRM验证找到了潜在的、能较好反应晚期肺腺癌治疗响应的蛋白标志物。