单细胞和空间转录组分析揭示了肝转移性结直肠癌的细胞异
文章简介 文章题目 Single-cell and spatial transcriptome analyse…
Stereo-seq技术揭示了人类肝癌浸润区促进肝细胞-肿瘤细胞窜扰、局部免疫抑制和肿瘤进展
文章简介 文章题目 Stereo-seq techniques revealed that infiltrat…
单细胞和空间转录组分析揭示了肝转移性结直肠癌的细胞异1
文章简介 文章题目 Single-cell and spatial transcriptome analyse…
绝了！利用GEO数据库快速发表科研论文
这项研究下载了GEO数据库已经发表的白癜风患者的皮肤组织样本的转录组数据和白癜风患者的外周血的转录组数据，对差异的DEG基因和免疫细胞的类型进行相关性分析。
转录组测序分析可变剪接轻松上6分-快来抄作业
这项研究利用转录组测序技术揭示了不同时期慢性髓系白血病患者的转录图谱。运用ABLas可变剪接分析流程比较了两类患者中的可变剪接调控模式，急变期白血病患者表现出更显著的剪接失调。筛选出辅助剪接因子hnRNPA1可作为区分白血病患者和健康人的的生物标志物。实验证明hnRNPA1的全长剪接亚型A1-b在急变期患者中表达明显升高，这种独特的表达模式可能为白血病急慢性患者的分类提供新的预后指标。
【最新！胃癌的单细胞测序研究】成纤维细胞在调节肿瘤微环境中的独特作用
通过8名胃癌患者的癌组织和癌旁粘膜组织进行单细胞转录组测序，解析了胃癌肿瘤微环境中CAFs的分类、功能、起源及与其他细胞亚群的相互作用，并进一步验证CAFs在不同病理类型中的空间分布。这些结果揭示了CAFs在调节肿瘤微环境中的独特作用，参与免疫调节、侵袭、迁移和血管生成等过程。值得注意的是，胃癌中eCAF趋化能力增强，促进了M2巨噬细胞的招募，并与胃癌患者预后不良有关，表明抑制eCAF激活可能是胃癌患者潜在的治疗靶点。
RIP-seq方法研究miRNA靶标（附高分案例）
研究表明JNK/miR-31/Cdc42的反馈调节在维持肝细胞稳态中具有重要作用。运用RIP-seq检测技术，发现miR-31通过结合并抑制Cdc42的表达和活性，抑制JNK的激活，从而缓解肝细胞损伤。因此可以推测，miR-31可能具备作为药物传递分子来增强药物对抗APAP诱导的DILI的治疗潜力。
单细胞 RNA 测序揭示人类胆囊癌进展的多样性和瘤内异质性
本研究利用单细胞RNA-seq技术揭示了胆囊癌进展过程中多细胞群广泛的重编程，通过对正常、原发和淋巴结转移肿瘤组织的细胞亚型的全面描述揭示了细胞的异质性和分化谱系，并揭示了免疫耐受环境和胆囊癌发展和进展中的亚群。这些发现为进一步研究胆囊癌的特征和潜在的治疗靶点提供了新的思路。
Plant Cell | PAS-seq技术助力RNA加工复合体调控植物免疫研究
本文的研究揭示了：1）CPR5是一个SR家族RNA结合蛋白；2）RNA剪接因子NTC和RNA poly(A)加尾因子CPSF协同调控植物免疫；3） CPR5将RNA加工和植物免疫两大基本的生命过程联系起来
RNA的m6A修饰是表观遗传学研究领域热点之一
目前，大量研究已经证实m6A修饰具有重要功能：在分子功能层面，m6A修饰影响RNA的转录、加工、运输、翻译、降解等一系列过程(Yang et al., 2018)；在生物学功能层面，m6A修饰参与调控生长发育、细胞分化、癌症发生发展等生物学过程。