【Poly(A)-seq技术】有效且高质量解决mRNA尾研究的问题
Poly(A)-seq技术的方便性和稳定性会带给全球许多实验室新的机遇,推动一批创新性优秀成果的产出。我们希望我们团队提供的Poly(A)-seq技术服务可以惠及全国科研院所和医院的多个研究团队,助力各团队抓住这个新的科研机遇,产生创新性研究成果,实现新的突破。
We translate sequences to science and industry.
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首先,通过构建IGF2BP2敲除的巨噬细胞,探索炎症诱导下,IGF2BP2敲除对M1和M2型巨噬细胞激活的影响;
其次,通过iRIP-seq等实验明确了IGF2BP2在巨噬细胞表型激活中的作用机制;
最后,通过建立结肠炎和哮喘小鼠模型,利用小鼠的骨髓细胞交叉移植等实验,验证了IGF2BP2在炎症疾病中的功能。
分析TCGA 数据中参与同一 TF-iGEN相关基因的表达的生存关系,TF-iGEN 网络与免疫浸润之间的联系以及eQTL分析等,从而提出一种识别调节免疫浸润的 TFs 的方法,并且为多种癌症提供了新的潜在预后指标和可能的治疗靶点
运用ChIRP-MS和RNA pull down检测技术,发现lncRNA PFI通过结合并抑制剪接因子SRSF1的表达和活性,抑制EDA + Fn1剪接异构体的产生,从而参与肺纤维化的调控。因此可以推测,诱导PFI表达可能为预防和治疗PF提供一种新的途径。
我们开发出了独立自主的AS分析软件:剪接位点使用变异分析(SUVA)。SUVA在检测AS事件方面显示出比其他方法更高的灵敏度和准确性。
作者揭示了细胞骨架蛋白MACF1调控成骨细胞分化的机制。当细胞内MACF1水平较高时,MACF1会与细胞骨架及微管蛋白结合,从而有效的隔离了细胞质中成骨分化相关的抑制因子,确保了成骨细胞的动态分化过程。当细胞内MACF1降低时,成骨分化相关抑制因子会核易位进入细胞核中,从而抑制成骨分化相关基因的转录(
该文章基于单细胞技术解析了HIV感染者和健康对照外周血T细胞转录组图谱,发现HIV感染者外周血MAIT细胞共刺激分子和干扰素诱导基因显著上调。
这项研究表明了选择性剪接在塑造低等真核生物的转录组和蛋白质组复杂性中的普遍作用。结合数十种复杂的可变剪接模式的鉴定,可变剪接机制在黄萎病菌中具有重要的作用。黄萎病菌不同AS模式的频率和分布与通过EST分析或转录组测序检测到的拟南芥和水稻的AS频率和分布惊人地相似,按高低排序为IR,A3SS,A5SS和ES。在可变剪接调控的基因的功能聚类表明,在真菌发育和繁殖,信号转导,线粒体软骨功能以及许多其他生物学功能(包括转录和转录后过程)中可变剪接发挥着关键作用