RBP研究数据包的优势
RNA结合蛋白与我的研究有关吗？
RNA结合蛋白（RBPs）是一类能够与RNA分子特异性结合的蛋白质，通过经典RNA结合域（如RNA识别基序RRM、DEAD-box解旋酶域）或非经典结构域（如固有无序区）识别RNA靶标。人类基因组编码超过2000种RBPs，其功能贯穿RNA的整个生命周期。
RNA结合蛋白可以与circRNA，lncRNA，miRNA非编码RNA结合互作，同时和当下肿瘤免疫，T细胞免疫治疗法，m6A修饰，单细胞测序，可变剪切，CRISPR-Cas9，等很多热点都有密切关系，并有重大发现，很值得我们深入研究。
可以说，没有RBPs，RNA无法发挥任何生理作用。
RBP研究数据包是什么？
RBP沉默/过表达数据包
通过文献检索，数据库分析等方式,确定和疾病研究相关的RBP，根据RBP具体的功能，利用转录组测序技术(RNA-seq)，从整体水平研究RBP沉默/过表达对基因表达模式，表达水平，功能通路以及可变剪接事件的影响，提供全面的转录组信息。还可以选择细胞功能实验:细胞增殖、凋亡、侵袭、转移以及和特定疾病相关的功能实验。
RBP的iRIP数据包
iRIP-seq技术可以鉴定与特定RBP直接和间接结合的RNA，获得结合基序，结合强度和结合靶标等信息，可以为沉默/过表达产品的分析结果提供更稳固和更直接的证据，从整体水平研究RBP的功能和作用机制。
案例解析
英文题目：Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 2-regulatedalternative splicing of nuclear factor 1 C-type causes excessive granulosacell proliferation in polycystic ovary syndrome
中文题目：IGF2BP2选择性剪接导致多囊卵巢综合征颗粒细胞过度增殖
期刊：Cell Proliferation
发表时间：2022
目的：多囊卵巢综合征(PCOS)是一种常见的生殖内分泌疾病。胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2 (IGF2BP2)作为HMGA2的靶向基因可促进颗粒细胞(GCs)增殖。然而，IGF2BP2是否作为RNA结合蛋白(RBP)参与PCOS的发病机制，目前尚不清楚。在本研究中，作者旨在阐明与IGF2BP2发生相互作用的转录本、全转录组以及GCs中的可变剪接，从而揭示PCOS发病的潜在机制。
材料与方法：采用定量反转录PCR (RT-qPCR)和Western Blot检测PCOS患者GCs中IGF2BP2的表达。通过RNA免疫沉淀测序(RIP-seq)和RNA测序(RNA-seq)捕获了IGF2BP2相互作用的转录本、全转录组以及可变剪接。转染过表达IGF2BP2质粒和核因子1 c型(NFIC) siRNA的KGN细胞，并利用CCK-8、EdU和TUNEL进行检测。
结果：IGF2BP2在PCOS患者GCs中高表达。IGF2BP2作为一个RBP，优先结合mRNA的3’和5’UTR区域，结合基序为：GGAC和新发现的GAAG基序。IGF2BP2的过表达改变了KGN细胞的转录组图谱。IGF2BP2通过抑制NFIC的外显子跳跃事件，调控可变剪接事件，促进细胞增殖。
