案例一
IF 8.1
Am J Hum Genet · 血浆代谢物
Whole-exome sequencing identifies rare genetic variants associated with human plasma metabolites
全外显子组测序确定与人类血浆代谢物相关的罕见遗传变异
期刊：The American Journal of Human Genetics（IF 8.1，2024 JCR） · 发表时间：2022 年
阅读原文：doi.org/10.1016/j.ajhg.2022.04.009
样本与方法：该研究使用多种方法在蛋白质编码区选择和聚集罕见的遗传变异，并使用超高效液相色谱-串联质谱检测了它们与血浆中测定的 995 种代谢物的相关性。
研究发现：研究鉴定了 40 个新的涉及罕见编码变异的关联（27 个基因和 38 个代谢物），其中 28 个（15 个基因和 28 个代谢物）被复制。作者开发了一种算法来对每个位点上假定的驱动变异进行优先排序，并使用中介和孟德尔随机化分析来测试 ACY1 位点上代谢物和蛋白质水平关联的方向性。
总的来说，66% 的报告关联涉及已批准的药物或生物活性药物样化合物的基因靶点，有助于药物靶点的验证努力。这一思路也可迁移到其他组学-表型关联研究中：用 WES 拿罕见编码变异，与代谢 / 生化表型做关联，直接指向可成药的靶点。