Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 2-regulated alternative splicing of nuclear factor 1 C-type causes excessive granulosa cell proliferation in polycystic ovary syndrome
IGF2BP2 调控 NFIC 可变剪接导致多囊卵巢综合征颗粒细胞过度增殖
期刊:Cell Proliferation(IF 7.6,2026 年 6 月发布的最新 JCR) · 发表时间:2022 年 · 卷期:55(4):e13216
我司支持:iRIP-seq 与 RNA-seq 建库测序及数据分析
阅读原文:doi.org/10.1111/cpr.13216
研究目的:多囊卵巢综合征(PCOS)是常见的生殖内分泌疾病。IGF2BP2 作为 HMGA2 的靶基因,已知能促进颗粒细胞(GCs)增殖,但它作为 RNA 结合蛋白参与 PCOS 发病的机制并不清楚。作者要回答的是:IGF2BP2 到底结合了哪些转录本,全转录组和可变剪接发生了什么变化,这些变化能不能解释颗粒细胞的过度增殖。
材料与方法:用 RT-qPCR 和 Western Blot 检测 PCOS 患者颗粒细胞中 IGF2BP2 的表达;用 RIP-seq 和 RNA-seq 分别捕获 IGF2BP2 相互作用的转录本、全转录组与可变剪接;在 KGN 细胞中转染 IGF2BP2 过表达质粒和 NFIC siRNA,配合 CCK-8、EdU 和 TUNEL 检测增殖与凋亡。
研究结果:IGF2BP2 在 PCOS 患者颗粒细胞中高表达。作为 RBP,它优先结合 mRNA 的 3′和 5′UTR 区域,识别基序为 GGAC 以及一个新发现的 GAAG 基序;过表达 IGF2BP2 改变了 KGN 细胞的转录组图谱;机制上,IGF2BP2 通过抑制 NFIC 的外显子跳跃事件调控可变剪接,从而促进细胞增殖。
与两套数据包的对应关系:RIP-seq 对应 iRIP 数据包(结合位点、结合基序、靶标清单),RNA-seq 对应沉默/过表达数据包(差异表达、通路富集、可变剪接),CCK-8/EdU/TUNEL 对应可选的细胞功能实验。你要做的是把 RBP 换成自己课题的那个。